Indépendamment de la transmission de génération en génération, des transferts horizontaux de gènes ont lieu (par des virus, lors de conjugaison bactérienne...).
Ces échanges sont permis car l'ADN est universel.
Ainsi, des gènes de résistances aux antibiotiques peuvent se propager dans les populations bactériennes, rendant un traitement inefficace.
Les transferts de matériel génétique peuvent être plus importants encore : des endosymbioses expliquent la présence de chloroplastes ou de mitochondries (possédant de l'ADN) dans les cellules eucaryotes.
Outre la diversification génétique, d'autres mécanismes sont impliqués dans la diversification phénotypique:
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Association bénéfique (symbiose), ou néfaste (parasitisme).
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Utilisation de composés inertes de l'environnement (parures, constructions...).
Par ailleurs, la transmission culturelle des comportements peut créer de la diversité au sein d'une population: ce comportement sera soumis à la sélection de l'environnement, ou être perdu par hasard.