Les micro-organismes rassemblent les organismes non visibles à l’œil nu. Leur petite taille nécessite l’utilisation d’un microscope pour être observés. Le monde microbien est très diversifié : bactéries, virus, parasites, champignons… Ils sont omniprésents dans l’environnement (air, eau, sol…).
Certains micro-organismes sont inoffensifs, sans danger pour les êtres humains. D’autres sont pathogènes et responsables de maladies. La contamination est la pénétration d’un micro-organisme pathogène dans un être vivant. Elle peut se faire par voie cutanée, voie aérienne…
Le microbiote est l’ensemble des micro-organismes présents sur et dans l’organisme. Certains sont présents sur la peau, d’autres dans les voies urinaires et génitales… L’Homme héberge également, dans son tube digestif, des micro-organismes qui vivent en symbiose avec lui. Ils constituent le microbiote intestinal. Il aide à la digestion et ont un rôle dans l’immunité.