Le monde microbien est très diversifié. Les bactéries appartiennent aux procaryotes, qui ne possèdent pas d'organites comme les eucaryotes (mitochondries, réticulum endoplasmique, Golgi), les levures sont des eucaryotes, les virus sont des entités biologiques.
On trouve donc :
Les bactéries : qui sont de formes variées (bâtonnets et cônes) et responsables de nombreuses infections, on les traite par des antibiotiques.
Les virus : ce sont des entités biologiques, parasites obligatoires qui n'ont pas de cellule mais une enveloppe, une capside et un acide nucléique, on les traite avec des antiviraux.
Les champignons : on trouve les levures et les moisissures qui peuvent sécréter des mycotoxines. Ils sont responsables de mycose, on les traite par des antifongiques.
Les parasites : qui sont des animaux microscopiques souvent présents dans les eaux souillées. On les traite par des antiparasitaires.
Les prions : qui sont des protéines anormales.
