La diagenèse comprend l’ensemble des modifications que subit un sédiment depuis son dépôt à la formation d’une roche sédimentaire. Les différentes étapes sont d’intensité variable en fonction de la nature et de la profondeur d’enfouissement. Mais elle comprend 5 étapes qui se recoupent :
- la dégradation de la matière organique par les microorganismes présents ainsi que des transformations minéralogiques liées à l’état de stabilité des minéraux en fonction de la profondeur (exemple de la transition aragonite/calcite) ;
- l’authigenèse ou la néoformation de minéraux comme la glauconie par exemple ;
- La cimentation, qui se produit par dissolution et recristallisation dans les interstices, réduisant la porosité initiale ;
- La compaction, car, sous l’effet de l’enfouissement, l’augmentation de pression entraîne une diminution de la porosité et donc une compaction des roches ;
- La déshydratation qui augmente avec la profondeur, avec l’élimination d’abord de l’eau interstitielle, puis de l’eau
interfoliaire au sein de minéraux.
Ces différentes étapes aboutissent, à mesure de l’enfouissement des sédiments liées à la subsidence et au recouvrement par d’autres sédiments, à la formation de roches sédimentaires.