La phonologie ne doit pas être confondue avec la phonétique qui est un autre domaine des sciences du langage.

La phonologie étudie les sons dans une perspective systémique : autrement dit la façon dont les phonèmes s’organisent en tant que système.

La phonétique, souvent confondue avec la phonologie, concerne pour sa part l’étude des sons dans leurs réalisations matérielles (articulatoires, acoustiques, auditives). Cette discipline étudie la composition de l’appareil phonatoire, soit l’ensemble des organes qui permettent aux humains de parler.

L’Alphabet Phonétique International (API) décrit l’ensemble des sons du langage selon les principales caractéristiques articulatoires des sons. L’API permet de transcrire une forme sonore de façon identique, quelle que soit la langue du locuteur.

La notation phonétique utilise les crochets [ ] pour mettre en évidence la réalisation effective des sons, indépendamment de la catégorie à laquelle ils renvoient dans la langue. La notation phonologique utilise pour sa part les barres obliques // pour transcrire les phonèmes.