L'immunité innée est un mécanisme génétiquement déterminé et stéréotypé, présent dès la naissance et qui ne nécessite aucune sensibilisation préalable pour se déclencher. C'est la première ligne défensive du corps contre de nombreuses agressions (infections, lésions, cancers...). Son principe de fonctionnement est très conservé dans l'évolution. Des centaines de molécules circulantes et plusieurs types cellulaires sont impliqués dans cette réaction.

Elle se déclenche très rapidement et se prolonge tout le temps de l'infection. 

La réaction inflammatoire aiguë en est un mécanisme essentiel. Elle fait suite à l'infection ou à la lésion d'un tissu et met en jeu des molécules à l'origine de symptômes stéréotypés (rougeur, chaleur, gonflement, douleur). Ces symptômes traduisent la présence de molécules et de cellules de l'immunité, actives au niveau de la zone infectée.

Cette réaction prépare un processus plus spécifique, l'immunité adaptative, qui vient s'ajouter le cas échéant, pour combattre l'infection.