Il existe différentes flores :
- La flore mutualiste. Elle regroupe les bactéries de la flore intestinale comme Bifidobacterium bifidum.
- La flore utile. Elle est utilisée en industries, par exemple dans les laits fermentés (Lactobacillus acidophilus…).
- La flore pathogène. Elle est responsable de maladies.
Au laboratoire, la recherche d'une flore particulière nécessite plusieurs étapes :
- Utiliser un milieu d’enrichissement : milieu liquide ou solide favorisant la croissance du micro-organisme
- Revivification
- Identifier les colonies suspectes
- Réaliser un sérotypage
Pour identifier un micro-organisme, on peut utiliser des galeries d’identification biochimiques qui permettent de mettre en évidence les enzymes spécifiques ou les produits du métabolisme des micro-organismes.
Pour dénombrer les micro-organismes, plusieurs méthodes peuvent être utilisées :
- Dénombrement de masse
- Dénombrement en surface
- Dénombrement après culture sur filtre
- Dénombrement en milieu liquide
- Estimation de la biomasse
- Cytométrie
- Dénombrement par ATPmétrie (méthode indirecte)
