Les types trophiques permettent de préciser les conditions de culture des micro-organismes : la nature des sources en énergie, en électrons et carbone.
Concernant les sources d’énergie et de carbone, on distingue :
Au laboratoire, les milieux de culture doivent être adaptés à la croissance du micro-organisme. Ils ont donc des caractéristiques :
- Ils peuvent être liquides ou gélifiés selon la concentration en agarose
- Ils ont un pH optimal qui varie selon le micro-organisme (pH entre 7,2 et 7,4 pour les cellules animales)
- Ils doivent apporter divers composants : eau, source d’énergie (glucose…), source d’atomes (C, H, O, N…), facteurs de croissance, sels minéraux…
Les champignons microscopiques sont des organismes eucaryotes. On distingue les levures (et les protozoaires) qui sont unicellulaires et les moisissures qui sont pluricellulaires. Ils se différencient sur plusieurs points :
