Les microorganismes sont des organismes si petits qu’ils ne sont visibles qu’à travers un microscope. Bactéries, champignons, algues vertes microscopiques ou même virus sont assemblés dans cette catégorie d’organismes. 

Pour se nourrir, les microorganismes ont besoin de substances organiques telles les lipides, les glucides ou les protides, de substances minérales, de vitamines et d’eau. On distingue les eucaryotes qui possèdent un noyau et ont une taille moyenne de 5 à 20 μm et les procaryotes qui n’ont pas de noyau et mesurent de 0,5 à 1 μm. 

Les microorganismes colonisent tous les écosystèmes (sol, air, eau..) et sont indispensables à l’homme et à l’environnement. Certains peuvent pourtant être pathogènes et entraîner une maladie chez les plantes ou les animaux et l’homme.